آذرستان دارای ساختاری منظم و کارآمد است که با هدف تسهیل فرآیندهای اجرایی، مدیریتی و پشتیبانی طراحی شده است. این ساختار شامل بخش‌های هیات مدیره، مدیرعامل، مدیر کارخانه، واحد تولید، واحد کنترل و تضمین کیفی، واحد فنی و مهندسی، واحد برنامه‌ریزی و کنترل پروژه، واحد مدیریت پروژه‌ها، واحد تدارکات و پشتیبانی، واحد منابع انسانی، واحد مالی، واحد انبار، واحد نگهداری و تعمیرات، واحد ارسال، واحد HSE و واحد مدیریت داخلی می‌باشد. هر بخش با همکاری نزدیک با دیگر واحدها تلاش می‌کند تا پروژه‌ها با بالاترین کیفیت و در کوتاه‌ترین زمان ممکن اجرا شده و رضایت مشتریان تأمین شود.